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[알고리즘]BOJ_1969_DNA(파이썬 collections모듈의 Counter사용하기, Counter객체를 정렬하기, 문자열에서 문자하나하나 리스트로 입력받기, 2차원 리스트 입력받기) 본문

공부/알고리즘(파이썬)

[알고리즘]BOJ_1969_DNA(파이썬 collections모듈의 Counter사용하기, Counter객체를 정렬하기, 문자열에서 문자하나하나 리스트로 입력받기, 2차원 리스트 입력받기)

도토리까꿍v 2021. 6. 3. 21:07
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#문제 링크

https://www.acmicpc.net/problem/1969

 

1969번: DNA

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오

www.acmicpc.net

#문제

https://www.acmicpc.net/problem/1969
DNA

시간 제한	메모리 제한	제출	정답	맞은 사람	정답 비율
2 초	128 MB	4114	2213	1877	56.844%
문제
DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다.
이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine).
우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때,
이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다.
만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로
이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다.
그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때,
각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다.
만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.

우리가 할 일은 다음과 같다.
N개의 길이 M인 DNA s1, s2, ..., sn가 주어져 있을 때
Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA s를 구하는 것이다.
즉, s와 s1의 Hamming Distance + s와 s2의
Hamming Distance + s와 s3의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.

입력
첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다.
그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다.
N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.

출력
첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고,
둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오.
그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.

예제 입력 1
5 8
TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT
예제 출력 1
TAAGATAC
7
예제 입력 2
4 10
ACGTACGTAC
CCGTACGTAG
GCGTACGTAT
TCGTACGTAA
예제 출력 2
ACGTACGTAA
6
예제 입력 3
6 10
ATGTTACCAT
AAGTTACGAT
AACAAAGCAA
AAGTTACCTT
AAGTTACCAA
TACTTACCAA
예제 출력 3
AAGTTACCAA
12

#답안

import sys
import collections

input=sys.stdin.readline

#n과 m을 입력받는다.
n,m=map(int,input().split())

#DNA를 입력받는다. 
#ABCD
#ABCD 
#입력 시 [['A','B','C',D'],['A','B','C',D']]가 입력되도록
dna=[list(input().rstrip()) for _ in range(n)]

#dna리스트의 행과 열을 바꾼다.
tdna=list(map(list,zip(*dna)))

#결과를 나타낼 빈 리스트 생성
result=[]
cnt=0
#입력받은 DNA의 첫번째 글자들 ~ 마지막 글자들로 비교하며 가장 많이 나온 알파벳을 추출한다.
for tdna in tdna :
    # -value(음수)로 오름차순(즉, value 내림차순이라고 생각하며 편함), 동점이면 key 오름차순, 
    # 즉, 가장 많이 나온 순대로 정렬하되 동점이면 알파벳 순서대로 정렬한다.
    alpa=sorted(collections.Counter(tdna).items(),key=lambda x: (-x[1], x[0]))
    #결과에 가장 많이 나온 알파벳 붙이기
    result.append(alpa[0][0])
    #가장 많이 나온 알파벳의 개수 더하기
    cnt+=alpa[0][1]


print(*result,sep='')
#전체 문자 개수에서 가장 많이 나온 알파벳의 개수의 총합을 뺀다.
print(n*m-cnt)

👆풀이

 

🌂문제 이해

🌂문제 풀이

 

🌂코드 분석

 

+헷갈렸던 부분 char=sorted(collections.Counter(tdna).items(),key=lambda x: (x[1], x[0]))로 하면 생기는 문제점

 

원래 코드 char=sorted(collections.Counter(tdna).items(),key=lambda x: (-x[1], x[0])) 결과

#for문 안에서 char의 결과를 출력해보았다.
[('A', 5), ('T', 1)]
[('A', 5), ('T', 1)]
[('G', 4), ('C', 2)]
[('T', 5), ('A', 1)]
[('T', 5), ('A', 1)]
[('A', 6)]
[('C', 5), ('G', 1)]
[('C', 5), ('G', 1)]
[('A', 5), ('T', 1)]
[('A', 3), ('T', 3)]

└마이너스 숫자(음수)를 기준으로 오름차순 하는데 성공 (즉, 숫자를 기준으로 내림차순), 동점이면 알파벳을 기준으로 오름차순 하는데 성공해 각 리스트의 가장 빈도가 높은 맨 앞 요소를 뽑아오면 모두 성공적으로 추출된다. 

 

char=sorted(collections.Counter(tdna).items(),key=lambda x: (x[1]x[0])) 결과

[('T', 1), ('A', 5)]
[('T', 1), ('A', 5)]
[('C', 2), ('G', 4)]
[('A', 1), ('T', 5)]
[('A', 1), ('T', 5)]
[('A', 6)]
[('G', 1), ('C', 5)]
[('G', 1), ('C', 5)]
[('T', 1), ('A', 5)]
[('A', 3), ('T', 3)]

└숫자를 기준으로 오름차순 하는데 성공했고, 동점이면 알파벳을 기준으로 오름차순 하는데 성공했으나, 

각 리스트의 가장 빈도가 높은 맨 마지막 요소들을 추출하려고 보면 모두 잘 추출이 되나

맨 마지막에 [('A', 3), ('T', 3)] 여기서 A가 아닌 T를 추출하게 되므로 답은 틀리게 된다. 

 

 

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